物流行业普遍认为塑料托盘在物流载具的循环利用中具有更好的卫生特性，他们的根据是木托盘如果受潮了则容易发霉，上面会布满霉菌，如果与食品包装物接触不卫生，并且潮湿的木托盘如果与食品原材料接触，也容易使其受潮，潮湿的食品原材料是非常容易变质的。

而塑料托盘则不一样，合格的用于食品企业使用的是无毒无味，不吸水，不会受潮腐烂的，可以与食品原材料的外包装直接接触，然而德累斯顿木材技术研究所最新的一项研究用令人信服的研究成果证明这一观点是错误的。

在研究中，我们比较了EPAL埃帕欧标托盘和H1塑料托盘的微生物特性。所有被用于测试环节的载具样品均为按照各自质量检验体系进行过严格检测的符合其适用范围的托盘。

受测试托盘从托盘经销商及使用客户处采购而来，因此受测试样品均已被使用一次或多次。在接受测试前二者取样均未经过任何清洗。测试主要项目为大肠杆菌及金黄色葡萄球菌落分布。 

测试得出以下结论:“总体而言木质托盘上的抗菌活性高于塑料托盘。因此我们认为，在相对重要的物流运输中木托盘更适合食品运输。但是木托盘的使用仍然需要在食品的生产、运输和储存期间严格遵守相应卫生条例，并持续监测托盘质量和定期清理维护，这一点上木制托盘和塑料托盘仍然保持一致。”

塑料托盘生产商经常声称，木制托盘由于其粗糙的表面更容易受到微生物感染，然而这种说法无法得到证实。测试结果显示，在使用过的塑料托盘表面上，那些使用后产生的磨损部位同样是细菌的理想滋生地。相比之下，木材的天然卫生特性反而可以有效地抑制微生物的繁殖。